Zbirka medicine i ljekarništva obuhvaća ljekarnički inventar iz šest najvažnijih ljekarni koje su djelovale u Međimurju od 1777. godine do sredine 20. stoljeća: prve čakovečke ljekarne K Zrinskom iz 1777. godine smještene na Franjevačkom trgu; druge čakovečke ljekarne magistra Lajoša Göncza koja djeluje od druge polovice 19. stoljeća; treće čakovečke ljekarne K srcu Isusovom koju je 1927. godine otvorio magistar Teodor Košak u Ulici kralja Tomislava; ljekarne Sveti Jeromije iz Štrigove vlasnika magistra Aleksandera Schweitzera koja djeluje tijekom druge polovice 19. stoljeća i početkom 20. stoljeća; ljekarne u Donjoj Dubravi koja je otvorena krajem 19. stoljeća, a vodi je magistar Stjepan Antauer; te ljekarne iz Preloga koju je osnovao magistar Šipoš-Verly, a djeluje od kraja 19. do polovice 20. stoljeća.

Unutar stalnog postava Muzeja rekonstruiran je ambijentalni postav ljekarne koja kombinira inventar svih šest navedenih ljekarni. Namještaj (vitrine, ormari i ljekarnički pultovi) pripadaju stilskom razdoblju klasicizma i izrađeni su 1777. godine. Vitrine su popunjene ljekarničkim keramičkim i drvenim stojnicama te staklenim bocama i bočicama, a na svakoj od njih nalazi se naljepnica s latinskim imenom praška ili biljke koja je unutar njih bila spremljena. Tu su i precizne analitičke vage s utezima, laboratorijski stakleni pribor, veliki mužari i tarionici. Inventar je dopunjen poprsjem Vergilija te reljefnim medaljonima Esculapa i Higeje. Specifičan predmet predstavlja veliki izlog prve čakovečke ljekarne izrađen od dvostrukog stakla, od čega je donje staklo ogledalo, a prednje je ukrašeno historicističkim ornamentom i natpisom na mađarskom jeziku izvedenima u tehnici voska na staklu. Unutar postava prezentirani su i ljekarnički recepti. Svaka ljekarna imala je vlastitu omotnicu za recept i receptni papir s otisnutim imenom ljekarne, magistra koji ju vodi, a poneke i logom ljekarne (ljekarna K Zrinskom kao logo je koristila medaljon s portretom Nikole Zrinskog).

Najveći dio zbirke prezentiran je u postavu, osim nekoliko recepata arhiviranih u čuvaonici, i čini vjeran i autentičan preslik ljekarničke prakse kao i povijesnog vremena iz kojeg dotični predmeti potječu.

voditeljica zbirke: Maša Hrustek Sobočan, viša kustosica
porijeklo: otkupi, darovanja
vrsta predmeta: interijer ljekarne s izlogom, ljekarnički stakleni laboratorijski pribor, stojnice za ljekovite masti i praškove, bočice za lijekove, originalni recepti